Beethoven, le Saint-Bernard adopté par la famille Newton, est maintenant heureux dans sa nouvelle famille, mais se sent un peu seul. Il va tomber amoureux de la plus belle chienne du monde, Missy, qui va lui faire une portée de quatre magnifique chiots. Mais celle-ci est affublée d'une méchante maîtresse, qui veut vendre les chiots à un chenil...