A l'aube du 3ème millénaire où l'humanité, conditionnée, est réduite à une existence toujours menacée par des créatures végétales à l'apparence de femmes, les Sylvidres. Il existe un homme prêt à lutter contre cette invasion : Albator...
A bord de l'Atlantis, pourchassé par les siens, il commence une lutte acharnée contre les Sylvidres et la Reine Sylvidra pour protéger la Terre malgré tout.